Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VimP20152 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VimP20152 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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