Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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