Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18532 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18532 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
P18532 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P18532 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms