Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18527 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18527 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18527 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18527 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18527 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18527 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18527 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18527 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18527 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18527 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18527 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18527 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms