Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou4f1P17208 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pou4f1P17208 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms