Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhoP15409 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RhoP15409 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RhoP15409 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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