Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrphP15331 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrphP15331 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrphP15331 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrphP15331 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrphP15331 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrphP15331 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrphP15331 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms