Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms