Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms