Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb4P10284 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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