Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms