Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms