Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3cP0DOY1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms