Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf1P09925 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms