Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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