Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifna5P07349 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifna5P07349 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifna5P07349 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifna5P07349 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifna5P07349 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifna5P07349 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms