Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnfP06804 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnfP06804 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnfP06804 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms