Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms