Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BlmO88700 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BlmO88700 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BlmO88700 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BlmO88700 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BlmO88700 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BlmO88700 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BlmO88700 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BlmO88700 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BlmO88700 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BlmO88700 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BlmO88700 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms