Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm10509O88255 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm10509O88255 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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