Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stra6O70491 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Stra6O70491 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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