Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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BckdkO55028 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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BckdkO55028 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdkO55028 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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