Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms