Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjd2O54851 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjd2O54851 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms