Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChkaO54804 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms