Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FxnO35943 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FxnO35943 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FxnO35943 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FxnO35943 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FxnO35943 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms