Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Bnc1O35914 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Bnc1O35914 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bnc1O35914 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bnc1O35914 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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