Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sp100O35892 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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