Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cited2O35740 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms