Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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