Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TnxbO35452 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TnxbO35452 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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TnxbO35452 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms