Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Abcc1O35379 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Abcc1O35379 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Abcc1O35379 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Abcc1O35379 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Abcc1O35379 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Abcc1O35379 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Abcc1O35379 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Abcc1O35379 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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