Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ColqO35348 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ColqO35348 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ColqO35348 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ColqO35348 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ColqO35348 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ColqO35348 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ColqO35348 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ColqO35348 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ColqO35348 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ColqO35348 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ColqO35348 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ColqO35348 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ColqO35348 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ColqO35348 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ColqO35348 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ColqO35348 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ColqO35348 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms