Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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