Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArxO35085 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms