Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms