Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms