Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms