Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6871L7N248 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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