Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 AC159203.1-201ENSMUST00000222039 769 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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