Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm933J3QPC1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm933J3QPC1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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