Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm3415J3QMS8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm3415J3QMS8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm3415J3QMS8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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