Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm3336J3QMQ6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3336J3QMQ6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3336J3QMQ6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3336J3QMQ6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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