Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm21411J3KMS0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm21411J3KMS0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm21411J3KMS0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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