Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm20830J3KML6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm20830J3KML6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm20830J3KML6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm20830J3KML6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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