Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21719J3KMI9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms