Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms