Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms