Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20517G3UVU6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms