Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4aF8VPX6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms